Migren ve
epilepsi arasındaki genetik ve patofizyolojik benzerlikler dikkat çekmektedir.
Migrenli hastaların %10 kadarında baş ağrısından bağımsız benign fokal
epileptiform boşalımlar olabileceği düşünülmektedir. Bir çalışmada migrenli
çocukların % 10.2‟sinde ateşli ya da ateşsiz havale
öyküsü saptanmıştır. Yine aynı çalışmada baş ağrısı şikayeti olan çocukların
%11.7‟sinde spesifik EEG (elektroensefalografi) bulgusu saptanırken bu oran auralı migren olgularında %43.5 bulunmuştur. Auralı migren ve epileptik hastalıkların benzer genetik
bozukluklar nedeniyle değişen nöronal eksitabilitenin farklı klinik formları
olabileceği düşünülmektedir.